Aliran kerja percubaan ChIP-on-chip

Bermula dengan soalan biologi, eksperimen ChIP-on-chip dapat dibahagikan kepada tiga langkah utama: Yang pertama adalah untuk mengatur dan mengatur percubaan dengan memilih susunan dan jenis probe yang sesuai. Kedua, eksperimen sebenar dilakukan di makmal basah. Terakhir, semasa bahagian kering-kitaran, data yang dikumpulkan dianalisis untuk menjawab soalan awal atau mengarah kepada soalan baru sehingga kitaran dapat dimulakan lagi.

Bahagian makmal basah dari aliran kerja

Pada langkah pertama, protein yang diminati (POI) saling berkaitan dengan laman DNA yang diikatnya dalam persekitaran in vitro. Biasanya ini dilakukan dengan fiksasi formaldehid yang lembut yang dapat diterbalikkan dengan panas.

Kemudian, sel-sel tersebut dijumpai dan DNA dicukur dengan sonikasi atau menggunakan nuclease mikrokokok. Ini menghasilkan serpihan dua DNA helai serpihan DNA, panjangnya semula jadi 1 kb atau kurang. Mereka yang saling berkaitan dengan POI membentuk POI-DNA complex .

Gambar 127A | Gambaran keseluruhan aliran kerja eksperimen ChIP-on-chip. | Zirguezi / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_workflow_overview.svg) dari Wikimedia Commons

Gambar 127A | Gambaran keseluruhan aliran kerja eksperimen ChIP-on-chip. | Zirguezi / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_workflow_overview.svg) dari Wikimedia Commons

Pengarang : Milos Pawlowski

Rujukan:

Teknik Biologi Molekul I

Alat Biologi Molekul II

Ulasan