DNA urutan yang terikat pada protein tertentu dapat diisolasi dengan imunopresipitasi bahawa protein (ChIP), serpihan-serpihan ini kemudian dapat di hibridisasi menjadi microarray (seperti susunan ubin) yang memungkinkan penentuan penghunian tapak pengikatan protein di seluruh genom. Contoh protein untuk imunopresipitasi adalah pengubahsuaian histone (H3K27me3, H3K4me2, H3K9me3, dan lain-lain), protein kumpulan Polycomb (PRC2: Suz12, PRC1: YY1) dan protein kumpulan trithoraks (Ash1) untuk mengkaji landskap epigenetik atau RNA Polimerase II untuk mengkaji landskap penyalinan.
DamID
Dengan analisa ChIP, kawasan genom yang diikat oleh protein yang menarik dapat diasingkan dan digunakan untuk menyiasat microarray untuk menentukan penghunian tempat yang mengikat. Tidak seperti ChIP, DamID tidak memerlukan antibodi tetapi menggunakan metilasi adenin di dekat lokasi pengikatan protein untuk secara selektif memperkuat kawasan-kawasan tersebut, diperkenalkan dengan menyatakan sejumlah kecil protein minat yang disatukan ke bakteria DNA adenin metiltransferase.
Gambar 146A | Dua cip Affymetrix. Pertandingan ditunjukkan di kiri bawah untuk perbandingan ukuran. | Tidak ada pengarang yang boleh dibaca mesin. Schutz menganggap (berdasarkan tuntutan hak cipta). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) dari Wikimedia Commons
Pengarang : Milos Pawlowski
Ulasan
Catat Ulasan