Perbezaan antara snRNA-seq dan scRNA-seq

SnRNA-seq menggunakan nukleus terpencil dan bukan keseluruhan sel untuk memaparkan bentuk ekspresi gen. Maksudnya, scRNA-seq mengukur transkrip sitoplasma dan nuklear, sebaliknya snRNA-seq secara semula jadi mengukur transkrip nuklear (walaupun beberapa potensi transkrip dilampirkan pada endoplasma kasar reticulum dan sebahagiannya dipelihara dalam persediaan nuklear). Ini membolehkan snRNA-seq meneruskan nukleus dan bukan keseluruhan sel. Atas sebab ini, dibandingkan dengan scRNA-seq, snRNA-Seq lebih sesuai untuk menggambarkan bentuk ekspresi gen dalam sel yang sukar diasingkan (misalnya Adiposit, neuron), selain sebagai tisu yang diawetkan.

Selain itu, inti yang diperlukan untuk snRNA-seq dapat diperoleh dengan cepat dan mudah dari tisu segar, ringan, atau beku, sementara mengasingkan sel tunggal untuk sel tunggal RNA-seq( scRNA-seq) melibatkan inkubasi dan pemprosesan yang berlanjutan. Ini memberi keahlian kepada penyelidik untuk mendapatkan transkrip yang tidak terganggu semasa pengasingan.

Gambar 271A | Eksperimen snRNA-Seq asas yang tidak menggunakan aliran kerja DroNC-Seq akan mengikuti protokol yang serupa dengan yang | Simkrai / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Basic_snRNA-Seq_Workflow.png) from Wikimedia Commons

Pengarang : Yavor Mendel

Rujukan:

Teknik Biologi Molekul II

Alat Biologi Molekul VI