Yang pertama dari teknologi penjujukan throughput tinggi, penjujukan tandatangan

Yang pertama dari teknologi penjujukan throughput tinggi, penjujukan tandatangan selari secara besar-besaran (atau MPSS), dikembangkan pada tahun 1990-an di Lynx Therapeutics, sebuah syarikat yang ditubuhkan pada tahun 1992 oleh Sydney Brenner dan Sam Eletr. MPSS adalah operasi berdasarkan manik yang menggunakan complex berada di tangan penyesuai ligasi diikuti oleh penyahkodan penyesuai, membaca gabungan antara kenaikan empat nukleotida. Operasi ini menjadikannya rentan terhadap bias spesifik urutan atau kehilangan urutan tertentu. Atas alasan teknologi itu begitu complex, MPSS hanya dilakukan 'in-house' oleh Lynx Therapeutics dan tidak ada DNA mesin penjujukan dijual ke makmal bebas. Lynx Therapeutics bergabung dengan Solexa (kemudian diambil alih oleh Illumina) pada tahun 2004, yang membawa kepada pengembangan penjujukan-oleh-sintesis, yang lebih mudah diperoleh dari Manteia Predictive Medicine, yang menjadikan MPSS usang. Bagaimanapun, sifat penting keluaran MPSS adalah tipikal dari jenis data throughput tinggi kemudian, termasuk ratusan ribu urutan pendek DNA. Dalam kes MPSS, ini biasanya digunakan untuk mengurutkan cDNA untuk pengukuran bentuk gen tahap ekspresi.

Gambar 151A | Analisis penggabungan berbilang, terpecah-pecah mesti disatukan berdasarkan kawasan yang bertindih. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) dari Wikimedia Commons

Pengarang : Milos Pawlowski

Rujukan:

Teknik Biologi Molekul I

Alat Biologi Molekul II