Penjujukan berskala besar dan de novo penjujukan

Penjujukan berskala besar sering bertujuan untuk mengurai kepingan DNA yang sangat panjang, seperti yang ditunjukkan oleh seluruh kromosom, walaupun penjujukan berskala besar dapat dengan cara yang sama dapat digunakan untuk menghasilkan sebilangan besar urutan pendek, seperti yang ditunjukkan oleh yang terdapat di phage display. Untuk sasaran yang lebih panjang seperti yang ditunjukkan oleh kromosom, pendekatan umum terdiri daripada pemotongan (dengan enzim limitasi) atau ricih (dengan daya mekanik) serpihan DNA yang besar menjadi serpihan DNA yang lebih pendek. Fragmen DNA kemudian dapat diklon menjadi vektor DNA dan diperkuat dalam inang bakteria seperti yang ditunjukkan oleh Escherichia coli. Pendek DNA serpihan yang disucikan dari koloni bakteria secara individu diuraikan dan dipasang secara elektronik menjadi satu gabungan yang panjang dan bersambung. Kajian menunjukkan bahawa menambahkan langkah pemilihan ukuran untuk mengumpulkan DNA serpihan ukuran seragam dapat meningkatkan keberkesanan penjujukan dan ketepatan pemasangan genom. Dalam kajian ini, ukuran automatik terbukti lebih dapat dihasilkan dan tepat daripada ukuran gel manual.

Gambar 149A | Contoh hasil penjujukan penghentian rantai automatik DNA. | Abizar di Wikipedia Bahasa Inggeris / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) dari Wikimedia Commons

Gambar 149A | Contoh hasil penjujukan penghentian rantai automatik DNA. | Abizar di Wikipedia Bahasa Inggeris / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) dari Wikimedia Commons

Pengarang : Milos Pawlowski

Rujukan:

Teknik Biologi Molekul I

Alat Biologi Molekul II

Ulasan